「深港通」是在深圳證券交易所及香港交易所之間建立一個交易與結算的互聯互通機制。在這個機制包括「深股通」和「港股通」。
深股通，是指投資者委托本地經紀商，經由香港聯合交易所設立的證券交易服務公司，向深圳證券交易所進行申報（買賣盤傳遞），買賣規定範圍內的深圳證券交易所上市的股票。
港股通，是指投資者委托內地證券公司，經由深圳證券交易所設立的證券交易服務公司，向香港聯合交易所進行申報（買賣盤傳遞），買賣規定範圍內的香港聯合交易所上市的股票。
深股通股票將在以下幾種情況下被暫停買入（但允許賣出）：
(a) 該等深股不再屬於有關指數成份股；及/或
(b) 該等深股指數成份股在納入之後的定期檢討中，被認定市值少於人民幣60 億元；及/或
(c) 該等深股被實施風險警示；及/或
(d) 該等深股相應的 H 股不再在聯交所掛牌買賣 （視乎何者適用）
港股通股票將在以下幾種情況下被暫停買入（但允許賣出）：
(a) 其不再屬於有關指數成份股；及／或
(b) 該等港股相應的A 股不再在深交所掛牌買賣或被實施風險警示；及／或
(c) 沒有相應 A 股在深交所的恒生綜合小型股指數(HSSI)成份股，在納入之後的定期檢討中，市值少於港幣 50 億元；及/或
(d) 其相應的 A 股隨後在深交所以外的中國內地交易所上市
本地與海外投資者可選擇任何聯交所參與者買賣深股通股票，惟所選的聯交所參與者須符合資格參與深港通。
深港通為人民幣跨境投資, 設置每日額度上限，實行實時監控。額度利用按先到先得原則。
“上限”並非指每日流入總額上限，而是每日買賣之差不能超過的上限，所有額度均是買賣對減後的淨額度。每日額度每日更新及維持相同。未使用的每日額度不會結轉至下一日的每日額度。
每日額度餘額 = 每日額度 － 買盤訂單 ＋ 賣盤成交金額 ＋ 微調*
*每日額度餘額於下述情況下將會增加：
買盤訂單被取消，或
買盤訂單被對方交易所拒絕，或
買盤訂單以較佳價格執行
內地投資者買賣港股通股票將以港幣交易，與中國結算或其參與人則以人民幣交收。
本地與海外投資者買賣深股通股票將以人民幣進行交易及交收。
如每日額度餘額於開市集合競價時段（開市前）降至零或以下，新的買盤將被駁回，直至額度餘額回復正數水平。
如每日額度餘額於連續競價時段（連續交易）降至零或以下，日內餘下時間將不再接受買盤訂單。
須注意，已獲接受的買盤訂單不會因每日額度用盡受影響，除非交易所參與者取消訂單，否則將維持在交易所的訂單紀錄內。
北向交易將按照深交所的交易時間。聯交所將於內地市場早市及午市開市前五分鐘起接納聯交所參與者的北向訂單。
| 開市集合競價 | 09:15-09:25 | 09:10-11:30 |
| 連續競價（早市） | 09:30-11:30 |
| 連續競價（午市） | 13:00-14:57 | 12:55-15:00 |
| 收盤集合競價 | 14:57 - 15:00 |
於 09:20-09: 25、14:57-15:00，深交所不接受取消買賣盤的指令；
於 09:10-09:15、09:25-09:30、12:55-13:00，深交所不會處理任何指令，直至開市為止，但聯交所仍接受買賣盤訂單及取消買賣盤的指令；
在開市集合競價時段未被撮合的買賣盤訂單將自動進入連續競價時段，在連續競價時段 未被撮合的買賣盤訂單將自動進入收盤集合競價時段。
南向交易將按聯交所的交易時間進行。
深港通僅在深港兩地均為交易日且能夠滿足結算安排時開通。如果款項交收日港股市場不開市，深股通在此前一個交易日也將不開放交易。
若某一深股交易通的交易日為港股市場的半日市，深股交易通將繼續開放至深交所市場收市。
| 第一天 | 營業日 | 營業日 | 開放 |
| 第二天 | 營業日 | 營業日 | 不開放 | 款項交收日
港股市場不開市 |
| 第三天 | 營業日 | 假日 | 不開放 | 港股市場不開市 |
| 第四天 | 假日 | 營業日 | 不開放 | 內地市場不開市 |
經深港通進行北向交易的相關收費及稅項如下表:
| 經手費 | 成交金額 0.00487% | 雙邊 | 深交所 |
| 證管費 | 成交金額 0.002% | 雙邊 | 中國證監會 |
| 過戶費 | 成交面額 0.02% | 雙邊 | 中國結算 |
| 成交面額 0.02% | 雙邊 | 本地結算 |
| 交易印花稅 | 成交金額 0.1% | 賣方 | 國家稅務總局 |
有待進一步與監管及稅務部門確定的收費及稅項如下表：
| 證券組合費 | 就深股通股票向結算參與者提供托管及代理人服務的新收費(待香港證監會批准) | 本地結算 |
| 股息紅利稅 | 適用於分派股息(待國家稅務總局釐清) | 國家稅務總局 |
| 印花稅 | 適用於透過深港通買入的深股通股票(待國家稅務總局釐清) | 國家稅務總局 |
股息紅利稅將於深股通股票發行人及中國結算分派股息時預扣。證券組合費根據每名中央結算系統參與者的深股通股票的單一組合按月以港幣收取。